Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms