Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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