Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms