Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rnf144aQ925F3 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms