Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Prpf39Q8K2Z2 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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