Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms