Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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