Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms