Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Q3U6N9 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms