Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 546.7 ms