Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms