Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms