Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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