Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms