Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Smim18J3QNP2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms