Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm21818J3KMS6 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21818J3KMS6 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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