Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-M1F7CXU4 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms