Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q9CQC3 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q9CQC3 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms