Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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