Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rnf17Q99MV7 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms