Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Csmd1Q923L3 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms