Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccdc71Q8VEG0 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccdc71Q8VEG0 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc71Q8VEG0 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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