Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Cldn17Q8BXA6 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn17Q8BXA6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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