Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms