Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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