Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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