Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Znf48Q3US17 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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