Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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Usp39Q3TIX9 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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