Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ttc21bQ0HA38 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms