Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms