Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NcanP55066 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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