Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Sdc2P43407 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sdc2P43407 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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