Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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