Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprkP35822 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprkP35822 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms