Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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