Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ggta1P23336 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms