Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20830J3KML6 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms