Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms