Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Prrt4B2RU40 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms