Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm5538W4VSP6 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms