Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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