Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim39Q9ESN2 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim39Q9ESN2 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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