Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pacsin3Q99JB8 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms