Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Ccdc71Q8VEG0 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Ccdc71Q8VEG0 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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