Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Trappc12Q8K2L8 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc12Q8K2L8 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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Trappc12Q8K2L8 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms