Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Snx27Q3UHD6 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms