Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms