Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc39dQ0VF76 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms