Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Cntn3Q07409 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Cntn3Q07409 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms