Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1320-201ENSMUST00000096449 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms